CLC Genomics Workbench12下载信息

作者：二师兄的小弟二时间：2021-10-21 09:58:06

CLC Genomics Workbench12下载信息：软件大小为817KB。软件语言：中文。软件分类：行业软件。运行环境：WinAll。

CLC Genomics Workbench12是一款作用好用的NGS剖析软件，适用详细的重转录组测序步骤，专业用以检验和较为遗传变异，并且该软件还给予了一系列精确的组合探测器，能够用于检验单多肽链组合和多核苷酸组合。

CLC Genomics Workbench12安卓版内嵌的取代QIAGEN Biomedical Genomics Workbench，能协助客户追踪系统软件，还能提高特性，另外还容许客户致力于对检验到的变异生物开展分子生物学表述。

CLC Genomics Workbench12功能特色

1、重新排序

CLC Genomics Workbench支持完整的重测序流程，用于检测和比较遗传变异。处理大量样品时，高效的算法可减少运行时间，而可定制的分析工作流程和批处理则可将动手时间缩短到最小。

CLC Genomics Workbench允许您专注于对检测到的变异的生物学解释。

2、读取映射

重新排序的第一步是准确的读取映射。我们的算法经过优化，可以快速，高效地存储大量数据，以进行高质量的映射。

该算法为各种数据格式提供了全面的支持，包括短读取和长读取，以及成对读取数据的所有形式，无论插入大小或读取方向如何。它还支持使用混合数据集。局部重排可以大大降低某些变体类型的假阳性检测率。我们的目标是减少您的手工工作，并专注于从原始NGS读数中获得生物学上有意义的结果。

3、转录因子ChIP-Seq

即使在没有对照样品的情况下，最新的改进也有望对转录调控有更深入的了解。转录因子ChIP-seq暴露了整个基因组中转录结合位点的特征峰区域。通过我们久经考验且受信任的交互式图形用户界面，所有这些都可以访问。

4、亚硫酸氢盐测序

胞嘧啶甲基化可能是表观遗传调控基因表达的最佳研究形式。用于CLC基因组学工作台的Bisulfite测序插件可为科学家在研究胞嘧啶甲基化数据时面临的常见问题提供一站式解决方案。

5、工作流程

工作流将所选工具简化为一项分析。工作流可以批量运行，使其成为功能强大的工具，可在最少的用户干预下处理大量样品。您可以按照自己的科学出版物轻松地设置自己的工作流程，并与同事或其他研究人员创建并共享工作流程安装程序文件。商业附加组件引入了预配置的示例工作流程，以使您从数据到发布的速度更快。

6、de novo

我们值得信赖的de novo汇编器，并带有修整工具，可删除低质量的数据，从而快速提供汇编质量并有效地利用计算资源。就像我们的读取映射器一样，支持多种NGS数据类型，并且混合程序集结合了短读取和长读取的独特优势，从而获得了最佳结果。如果长读段的组装（例如PacBio）或基因组整理是主要重点，那么可以使用商业CLC基因组整理模块来增强CLC Genomics Workbench 。

7、RNA序列

免费的“ Advanced RNA-Seq插件”将所有分析步骤（从读数的二次分析到复杂的统计数据）集成到易于使用的工作流程中，并提供了从案例控制或多重分析等多种实验设计的访问权限组实验到多因素实验。所有工具都考虑了由于测序深度而引起的差异，从而无需对输入数据进行标准化。用于批次效应的多因素统计控制，并支持配对研究。统计结果可以在基因组环境中显示为轨迹，表视图或通过许多利用元数据的可视化选项进行可视化：火山图，二维热图，主成分分析和维恩图。

8、组蛋白ChIP-Seq插件

组蛋白的乙酰化是重要的表观遗传适应，与染色质去浓缩和基因表达上调或下调有关。用于CLC基因组学工作台的Histone ChIP-Seq插件可检测基因或其他预定义基因组区域中Histone乙酰化标记的证据。

9、变异分析

CLC Genomics Workbench提供了一系列准确的变体检测器，可检测单核苷酸变体（SNV），多核苷酸变体（MNV），中小尺寸的插入，缺失或替换以及大型结构变体。仅由一小部分映射读物支持的灵敏检测所谓的“低频”变异的算法就构成了检测工具。为了使检测出的变异有意义，CLC Genomics Workbench提供了一系列过滤器和比较工具。

10、元基因组学

发现微生物群，其元基因组和宿主之间的关键相关性。通过用于分类学和功能性微生物组分析的工具和简化的分析工作流程，可以轻松了解复杂的宏基因组学数据。借助诸如CLC微生物基因组学模块（超链接）之类的商业附加产品，工作台成为微生物学家的领先解决方案。

11、还有更多功能：

使用CLC Genomics Workbench，您可以享受更多属于每个生物信息学专家库的工具。享受丰富的系统发育工具集，创建自己的BLAST搜索，设计PCR或实时PCR引物，并利用分子生物学工具开发10年的优势。