洛克人X3玩家可以从Zero和axl中选择。Zero擅长挥舞光剑,操作他战斗时与经典的横卷轴动作游戏没有什么区别,Zero会使用各种连续剑击,另外二段跳等经典设定同样存在。在对抗BOSS的时候还可以叫出axl,进行双人联携攻击,给对方造成更大的伤害。这种双角色系统时本作的一大重点,例如当你被敌人抓走时可以呼唤出另外一名角色帮助脱围,此外根据一名角色的表现,另外一名角色的HP值将会得到补充。游戏中共有12个关卡,每打败一个BOSS就会获得新武器,另外在此之后还会出现次级目标。比较熟悉的玩法啦!